目的：分析公立医院院长专业背景对医院经济运行的影响并进行解释，为培养复合型医院管理人才和完善院长管理相关制度提供研究支持。方法：利用2005—2018年广东省公立医院院长个体和医院经济运行绩效数据，采用固定效应模型进行定量分析。结果：与非临床医学专业背景的院长所在医院相比，临床医学专业背景的院长所在医院的医疗收入、住院人次、医疗业务支出较低，病床周转率较高，差异有统计学意义（P＜0.05）；与未曾获得管理学相关学位且未参与管理培训的院长所在医院相比，获得管理学相关学位或参与管理培训的院长所在医院的资产负债率、管理费用较低，流动比率较高，差异有统计学意义（P＜0.05）。结论：对于临床工作关联紧密的经济运行指标，临床医学专业背景的院长因其临床一线学习和工作的经历优势，影响更显著；对于资产管理、行政和后勤管理工作关联紧密的经济运行指标，拥有管理学学习经历的院长在应用先进管理理念、方法、工具方面的优势更能得到显露和发挥，影响更显著。